由于缺乏全國統(tǒng)一的指導原則和開店政策，導致各地在審批時間、審批數(shù)量和準入資格審查等方面標準不一，這并不利于藥品零售市場的自由競爭，容易導致地方保護、暗箱操作等違規(guī)現(xiàn)象發(fā)生。往外擴張的大型連鎖站住腳后才發(fā)現(xiàn)，醫(yī)保定點資格是它們無法逾越的障礙。

       經(jīng)營連鎖藥店的成本并不低，而發(fā)展跨地區(qū)連鎖的成本更是異常之高。

      與單體店相比，經(jīng)營連鎖藥店的成本并不低，而發(fā)展跨地區(qū)連鎖的成本更是異常之高。每到一個新地方必須建立配送中心，相應也得增加一個總部機構(gòu)。事實上，不僅僅是跨省要建庫，跨市也要建庫。做藥店奡舒服的日子是開個六七家店，還未成為連鎖店的時候，一年賺個三四百萬。

      如果選擇收購，其實并不劃算，整合時可能碰到不可逾越的障礙，也會在成本控制、本地化經(jīng)營、政府關(guān)系方面遭遇難題。

      另外，若新版GSP能夠嚴格執(zhí)行，傳統(tǒng)的開店模式也面臨一大挑戰(zhàn)。本身執(zhí)業(yè)藥師短缺問題嚴重。沒有執(zhí)業(yè)藥師不僅僅意味著不能銷售藥，也意味著至少30%的銷售流失，這會讓藥店的生意難以為繼。

       自2004年起我國連鎖零售藥店數(shù)量呈逐年遞增趨勢，2005年連鎖藥店企業(yè)數(shù)量為1753家，較上年同期增長24.59%，為近年來增長比較快的年份。截至2013年底，我國連鎖藥店企業(yè)數(shù)量為3449家，較上年增加342家，增幅為11%。

      《中國連鎖藥店行業(yè)市場前瞻與智慧之選戰(zhàn)略規(guī)劃分析報告前瞻》數(shù)據(jù)顯示，近三年來直營百強企業(yè)的門店數(shù)量總體上呈上升趨勢：2011-2013年我國直營百強企業(yè)的總門店數(shù)量、門店數(shù)量在1000家以上的企業(yè)數(shù)及門店總數(shù)均呈逐年上升趨勢，2013年分別為32191家、12093家以及7個席位。2013年藥店百強中門店數(shù)量在100家以下的企業(yè)數(shù)以及門店數(shù)均較前兩年有所下降，分別為20家和1578家門店。

      從藥店總體數(shù)量來看，我國的藥店總數(shù)并不少，但和成熟市場相比，我國藥店結(jié)構(gòu)并不合理。需要優(yōu)勢連鎖企業(yè)整合行業(yè)資源來優(yōu)化產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)，資本和政策等將有力地推動這一進程。為此，連鎖企業(yè)除了關(guān)注以產(chǎn)品經(jīng)營為重點的內(nèi)生式發(fā)展外，還應當注重以資本吞吐和配置為重點的外延式擴張，投融資、并購重組等方式迅速做大企業(yè)規(guī)模，優(yōu)化產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)。

      未來五年，我國將利用市場機制和經(jīng)濟手段，鼓勵和支持大型藥品流通企業(yè)收購、兼并、托管、參股、控股和強強聯(lián)合等方式，實現(xiàn)規(guī)模化、集約化和國際化經(jīng)營，打造一批年經(jīng)營過百億元甚至過千億元的藥品流通龍頭企業(yè)；支持專業(yè)化和有特色的中小藥品流通企業(yè)做精做專，占領(lǐng)特色化細分市場；支持招牌藥店做長做久并創(chuàng)新發(fā)展；引導一般中小藥品流通企業(yè)加盟或并入大型藥品流通企業(yè)，實現(xiàn)規(guī)模化經(jīng)營。 同時，鼓勵藥品零售企業(yè)積極探索采取連鎖經(jīng)營等現(xiàn)代營銷方式，不斷提高市場競爭力。經(jīng)過五年努力，我國連鎖藥店比例要達到藥店總數(shù)的2/3，并全面配備執(zhí)業(yè)藥師，提高藥品質(zhì)量管理和藥學服務水平。“目前，我國38萬多家藥店，僅有4萬多執(zhí)業(yè)藥師，遠不能滿足群眾用藥指導、咨詢的需求。